La collection du Musée international d'art naïf de Magog compte plus de 1300 œuvres, produites par plus de 334 artistes, provenant de 42 pays différents. Le MIANM est le seul musée canadien exclusivement consacré à l'art naïf.
Quelque 240 œuvres représentent l'art naïf québécois (35% de la collection). La plupart de ces œuvres sont des huiles ou des acryliques sur toile, mais on trouve aussi d'autres médium et d'autres supports. Plusieurs de ces œuvres décrivent des scènes de la vie traditionnelles ou des scènes de la vie quotidienne d'aujourd'hui. La nature joue souvent un grand rôle. On y retrouve aussi l'expression d'une créativité artistique multiforme, explorant l'univers qui entoure les artistes naïfs avec un œil critique et parfois ironique. Le Musée possède aussi quelques œuvres d'autres artistes canadiens, particulièrement de l'Acadie.
La plus grande partie de la collection du Musée est constituée d'œuvres d'artistes étrangers. Trente trois pays sont représentés dans notre collection. C'est toutefois d'Haïti, de Roumanie et de France que nous viennent la plupart des œuvres d'art naïf étranger, si l'on excepte le Mexique et la Russie. En effet, ces deux pays sont très largement représentés dans notre collection, mais surtout par des œuvres d'artistes huichols ou par des œuvres d'art populaire ou religieux.
Le Musée compte un important corpus d'œuvres d'artistes huichols, ces indiens du centre du Mexique qui vivent encore, pour la plupart, selon leurs traditions ancestrales. Les Huichols produisent des tableaux de fils de laine (les " tablas ") et des sculptures et autres objets décorés de perles multicolores (les " kukas). Le support des tableaux est une planche de bois recouverte d'une fine couche de cire d'abeille collante. Avec un couteau ou son ongle, l'artiste trace ensuite le contour des esquisses sur la cire exposée à la chaleur pour la ramollir. Avec son pouce, l'artiste dispose alors sur la cire les brins de laine pour constituer ses motifs. Le Musée possède 76 tableaux de fils de laine et six objets décorés de perle. Du Mexique, le Musée possède aussi une collection de 50 tableaux réalisés sur du papier amate ainsi qu'une dizaine d'ex-votos (huile sur métal).
De l'ancienne Union soviétique, et particulièrement de Russie, le Musée possède 63 icônes qui démontrent toute la richesse de l'art religieux traditionnel, ainsi que 23 poupées gigognes et 17 boîtes laquées représentatives de l'art populaire russe.
On retrouve dans nos archives virtuelles certaines œuvres provenant de collections privées, qui furent en général prêtées à l'occasion d'une exposition.